Como han dicho otros, médicamente no hace ninguna diferencia qué brazo se usa. Debido a que el brazo donde recibió la inyección puede estar dolorido por un día o dos, cada vez que me he vacunado me han preguntado qué brazo preferiría. Como soy diestro, prefiero que usen mi brazo izquierdo para que cualquier dolor menor no sea inconveniente.
Por supuesto, si eres zurdo, tal vez prefieras que usen tu brazo derecho para el sitio de inyección.