Por lo general, no van a ningún lado. Se descomponen en sus nucleótidos componentes mediante exonucleasas nucleares (que casi parecen poéticas). En humanos, la mayor parte de esta actividad se lleva a cabo por XRN2.
Los ARN mensajeros maduros tienen una “cubierta” de proteína en su extremo 5 ‘que impide su degradación de esta manera, y una señal de poliadenilación en el extremo 3’ sirve como una señal de exportación nuclear. Las transcripciones que no están poliadeniladas tienen poca eficiencia de exportación, mientras que las transcripciones que carecen de un límite de 5 ‘tienen una estabilidad muy pobre. Si bien es posible traducir tales transcripciones, su contribución general a la proteína celular es pequeña.
La cosa es que algunos intrones forman estructuras secundarias plegándose y uniéndose a sí mismos. Algunas de estas estructuras las hacen direccionables mediante maquinaria de procesamiento de ARN alternativo, como Drosha, que reconoce un tipo de bucle de tallo en el ARN que se parece a esto [1]:
Drosha escinde ese sucker fuera de los intrones que están flotando alrededor del núcleo, y este fragmento de ARN (que llamamos “pre-microARN”) se exporta al citoplasma a través de un mecanismo que no se conoce muy bien (alrededor del 40% del tiempo, una proteína llamada SMAD4 se une a la cola del asa del tallo, y esta interacción es importante para obtener el pre-miRNA en el citoplasma, pero no sabemos por qué o qué sucede en el otro 60% de los casos) .
Una vez en el citoplasma, el pre-miRNA se divide por Dicer en miRNA maduro, que son ~ 22 nucleótidos de largo. Estos se unen a los ARN mensajeros en el citoplasma y reclutan el complejo de silenciamiento inducido por ARN (RISC) a los ARNm que llevan regiones de complementariedad parcial al miARN. RISC recluta XRN1, lo que degrada la transcripción del objetivo. De esta forma, los miRNAs funcionan para reducir la expresión de ciertos genes y no otros, representan un mecanismo indispensable para la regulación de genes.
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Sin embargo, no todos los miRNA están codificados a partir de intrones. Alrededor de la mitad se transcriben de sus propios promotores. Aún así, el mecanismo general aplica.
Finalmente, es importante observar que otros ARN no codificantes, como los ARN lnc, también pueden transcribirse como un intrón, pero evitan la degradación mediada por XRN2. Estos ARN generalmente permanecen en el núcleo y desempeñan papeles reguladores como partes de complejos ribonucleoproteicos o como silenciadores génicos que se unen al ADN y bloquean el progreso de la ARN polimerasa. Todavía se está trabajando mucho para comprender cómo se procesan estos lncRNAs.
Notas a pie de página
[1] MicroRNAs de insectos: de mecanismos moleculares a roles biológicos Parte 1
