16s rRNA es una parte de la subunidad ribosómica 30S en ribosoma procariótico. Los ribosomas procarióticos se componen de 2 subunidades a saber. 30S Y 50 S. Los ribosomas están principalmente involucrados en la síntesis de proteínas. Contiene anti Shine Dalgrano sequnces. Ambas subunidades se unen para la traducción de ARNm. r RNA significa RNA ribosomal.
El ARN 16s también tiene importancia en los estudios filogenéticos debido a que contiene regiones altamente conservadas que han cambiado muy lentamente durante la evolución, por lo que ayuda a agrupar las especies en función de eso. Además, hay algunas secuencias de firmas que son hipervariables y se pueden usar como etiquetas de identificación. La identificación bacteriana es confirmada por la secuenciación del rRNA 16s y encuentra significación en la identificación de bacterias no cultivables.