El objetivo es hacer una copia exacta, sin embargo, no somos tan capaces de hacer una copia sin errores como lo es una célula viva, y con frecuencia hay errores.
Recuerde que los experimentos de clonación se realizan típicamente a moléculas en solución, y para mejorar las posibilidades de éxito, se clonan un gran número de moléculas idénticas (de miles a millones) en el mismo experimento. Los protocolos exitosos incluyen alguna prueba que separa las moléculas que son al menos parcialmente correctas de las que no se modificaron. Un ejemplo común es agregar un gen a lo que está clonando que permite que una bacteria sobreviva a un medicamento. Cuando se completa la reacción de clonación, la mezcla resultante de moléculas de ADN se presenta a las bacterias y se les permite moverse dentro de las células. Las bacterias que toman el ADN que contiene el gen agregado sobreviven cuando se agrega el medicamento, y los productos de clonación que no han tenido éxito se eliminan por lavado. Los que quedan no son necesariamente perfectos, pero al menos contienen una parte del ADN deseado.
