¿No es la reproducción sexual simplemente el método de agregar un segundo conjunto de cromosomas coincidentes a los huevos para dar a las células del cuerpo 2 conjuntos para que puedan hacer órganos?

Básicamente sí, en lo que respecta a la primera mitad. Pero incluso los huevos de organismos asexuales también pueden producir órganos, por lo que esa no es la razón por la que necesitas la fertilización de un huevo.

La esencia real de la reproducción sexual es combinar los genes de dos padres diferentes para que la descendencia tenga diversidad genética y los padres tengan una mejor oportunidad de que al menos algunos de ellos sobrevivan variaciones (espaciales y temporales) en un entorno impredecible.

No exactamente. Si fuera así de simple, entonces la reproducción sexual no tendría casi la ventaja sobre la reproducción asexual que tiene. El ingrediente extra clave que la reproducción sexual agrega es la recombinación genética. Los dos padres no solo aportan su material genético a la descendencia, sino que ese material se mezcla de maneras que no están presentes en ninguno de los padres. Eso es lo que hace que la reproducción sexual sea tan poderosa como un componente de la evolución: no solo viertes los cromosomas de los padres en un vaso y los bebes; los pones en una licuadora y preparas un batido.