¿Cuáles son los factores más importantes que impulsan la evolución de las bacterias dañinas?

Cambios en la ecología bacteriana. Muchos patógenos importantes han evolucionado como resultado de la transferencia entre especies animales, por ejemplo, plaga jird a humanos. Otros son organismos ambientales que producen factores que causan enfermedades, por ejemplo, la toxina del cólera probablemente desempeña un papel en la estabilización osmótica del ambiente del vibrión, tal vez en los manglares. Otros se infectan con el fagot lisogénico y producen toxinas, difteria y botulismo.
Los seres humanos pueden cambiar la ecología bacteriana, por ejemplo, las legionelas pueden colonizar las unidades de aire acondicionado y, por lo tanto, las enfermedades humanas. La deforestación y las actividades en el desierto también ayudan a que las personas entren en contacto con patógenos inusuales, como la enfermedad de Lyme. Funciona bien para virus también, por ejemplo, zika y ebola
La secuencia parece funcionar de esta manera: las personas se mudan a una nueva área, alteran el medioambiente y están expuestas a bacterias que no han encontrado previamente; algunas bacterias se seleccionan para ser patógenas: desde el punto de vista de las bacterias, en este escenario, los seres humanos brindan oportunidades de colonización, pero esto puede causar que las personas se enfermen. La gente en los hospitales con antibióticos es básicamente una ecología alternativa.
El análisis de los genomas bacterianos sugiere que los patógenos actuales Mycobacterium tuberculosis y Shigella dysenteriae pudieron sobrevivir en las comunidades de cazadores recolectores. La mayoría de los otros patógenos requieren una población asentada más densa. Un análisis genómico similar ha sugerido que algunos factores de virulencia, como la toxina del cólera, evolucionaron antes que los humanos modernos