Después de leer un poco sobre este dispositivo (no estoy familiarizado con la electrofisiología), pero puedo intentarlo, parece que estás midiendo el flujo de iones a través de algún tipo de membrana.
Cuando se aplica un potencial eléctrico sobre los 2 lados, los iones intentarán fluir de mayor a menor potencial. Una corriente de cortocircuito básicamente nos dice cuán grande será la corriente entre los lados cuando nada más impide la corriente, hasta que la diferencia de potencial llegue a 0.
Sin embargo, no estoy seguro de qué quiere decir con corriente continua.
La membrana probablemente tenga un límite de cuántos iones pueden atravesar a la vez, y por lo tanto actúa como una resistencia. Eso es más o menos lo que es la corriente de cortocircuito: la corriente máxima posible a través de un sistema dado.
No tome mi respuesta como necesariamente correcta, ya que estoy respondiendo después de 5 minutos de lectura en el dispositivo y tratando de relacionarme con mi conocimiento general de ingeniería eléctrica.