Cuando las bacterias se ponen en una placa de Petri con condiciones ideales, ¿por qué mueren?

Parece que algo en la transformación salió mal. Si tiene bacterias que ya expresan el gen de resistencia a la ampicilina, trate de cultivarlas en su plato (si crecen, la placa está bien), ya que supongo que tiene múltiples placas del mismo lote de agar. También debe incluir un plásmido diferente con resistencia a la ampicilina que sepa que funciona al 100% cuando se transforma, ya que necesita un control positivo. Si tiene algunas placas libres de antibióticos, puede ver si la bacteria es viable después de la transformación mediante el recubrimiento de una cantidad muy pequeña (incluso algo como 1 ul está bien). También debe verificar dos veces la secuencia / mapa del plásmido para asegurarse de que no haya nada más que pueda interferir con la bacteria.

Deberías intentarlo de nuevo, a veces sucede una mierda. Verifique dos veces el procedimiento de transformación y asegúrese de que todas las temperaturas y horas sean las correctas. El paso de choque térmico es absolutamente crítico. Si no lo hace, también debe cultivar la bacteria en algo así como medio SOC durante 30-60 minutos a 37 grados antes de la siembra.

Mi respuesta, y dado que esta parece ser una investigación para la cual se te ha pedido que resuelvas el problema, es hacer otra o dos preguntas.

  • El color verde que usa es ver si la transformación realmente tuvo lugar y / o medir el nivel de transformación. ¿Viste colonias verdes en algún momento?
  • ¿Quiere decir que el plásmido contiene el código para la producción de ampicilina, el metabolismo de la ampicilina o la resistencia a la ampicilina? Esto hace una diferencia enorme. Si fue un código para hacer ampicilina , entonces le pregunto si sabe para qué se usa ampicilina. Si fue por el metabolismo de la ampicilina o la resistencia a la ampicilina, entonces le pregunto: ¿ha agregado ampicilina al agar o al caldo Luria?

Usando mis preguntas y tus respuestas, deberías ser capaz de desentrañar lo que sucedió en el plato.

Sus bacterias no parecen sobrevivir a la transformación.
Si las bacterias no transformadas pueden crecer en ese medio, pero una vez que las transformas nada crece, eso significa que su procedimiento de transformación las está matando.

Porque las transformaciones nunca son 100% exitosas y debería ver algunas bacterias no transformadas después de esto.

Si el medio es selectivo para bacterias transformadas, eso significa que sus bacterias no se transformaron con éxito. Verifique su procedimiento de transformación, su plásmido y si incluye todos los genes necesarios para la supervivencia en su medio selectivo.

Tal vez puedas aislar las bacterias después de la transformación, extraer su ADN y ejecutarlo a través de un gel para buscar plásmidos intactos que confirmen que realmente se están transformando.

tal vez la respuesta puede ser simple si pudiera proporcionar más detalles …

dijiste ‘ condiciones ideales’,

  • ¿Sus medios tienen la concentración óptima de ampicilina en ella? Como dices, las bacterias transformadas tienen un gen para la resistencia a la ampicilina, lo que significa que las bacterias transformadas necesitan la concentración óptima de ampicilina para crecer.
  • La transformación no es permanente: si las bacterias transformadas no crecen de forma inmediata / continua con el Biomarker (ampicilina en su caso) creando una presión positiva existe la posibilidad de que la bacteria pierda este plásmido que confiere esta resistencia y por lo tanto no puede crecer .

Ref .: pérdida espontánea de plásmidos resistentes a antibióticos transferidos a Escherichia coli en la infección vesical crónica experimental.

Hice algunas transformaciones en bacterias del ácido láctico hace mucho tiempo con un éxito limitado. Uno tiene que poner las células en un medio con alto ambiente osmótico. Para la regeneración de la pared.

Supusiste que la transformación fue exitosa, por lo que pones toda la suspensión celular en un medio con el antibiótico, con la expectativa de que las células transformadas se multiplicarán.

Mi especulación es que es posible que no tenga ninguna transformación o que algunos de los transformados murieron debido a un protocolo de recuperación inadecuado.

Esta pregunta es más adecuada para alguien que está trabajando con usted en este escenario específico. Parece que tienes que investigar un poco, porque no parece que hayas descubierto la causa raíz del problema.

No vamos a poder investigar este problema porque la única información que tenemos es la información que nos proporciona, de modo que para cuando tengamos suficiente información para responder a su pregunta, es probable que ya sepa la respuesta.

Por lo tanto, mi respuesta es “No lo sé”. ¡Buena suerte descubriéndolo! ”

No tengo mucha experiencia con este tipo de cosas, pero mis conjeturas serían: a) temperatura incorrecta, debería estar incubando a 37 grados para un mejor crecimiento. b) su plásmido es demasiado grande, lo que significa que causa una disfunción en la bacteria por lo que no puede replicarse / muere o algo así, o que no puede tomar el plásmido que lo hace resistente a la ampicilina, por lo que muere.
Cómo se realiza la transformación también podría afectar enormemente si el plásmido se absorbe.
De nuevo, no sé mucho sobre esto.