Cuando prepara los medios, el entorno en el que lo hace no es estéril, por lo que los medios no son estériles. Si ese es el caso, las bacterias indeseables crecerán en los medios.
En autoclave, todas las bacterias mueren, por lo que todo lo que crece es la bacteria que pretendes cultivar.
La esterilización en autoclave también ayuda a homogeneizar los medios (debido a la alta temperatura) ya que la solubilidad en agua aumenta a temperaturas más altas.
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