Una célula detecta daños en el ADN mediante mecanismos de reparación de recombinación de la replicación del ADN. Las mutaciones que ocurren en una posición o conducen a dímeros entre nucleótidos adyacentes causan lesiones y estructuras moleculares anormales localizadas. Estos y otros daños como mellas y roturas en el ADN se detectan por estas vías y se rectifican. Las bacterias y otras células también tienen compuestos que detectan las concentraciones de dímeros de nucleótidos y especies de iones reactivos (agentes para dañar el ADN) en los citoplasmas para activar el mecanismo de reparación mediante RecA bacteriana, rutas de mcr. El daño de los telómeros (terminaciones cromosómicas) en eucariotas conduce a la disociación de ciertas proteínas de unión teloméricas que también actúan como sensores de la inestabilidad cromosómica.
Para una comprensión conceptual, vale la pena leer el mecanismo lexA recA en bacterias que se requiere para el sistema de reparación SOS de inducción.