La microbiología se puede clasificar ampliamente como:
- Microbiología general
- Microbiología Aplicada
Pero las ramas de Microbiología se enumeran a continuación:
- Bacteriología: el estudio de bacterias.
- Micología: el estudio de los hongos.
- Protozoología: el estudio de los protozoos.
- Fitocología / algología: el estudio de las algas.
- Parasitología: el estudio de parásitos.
- Virología: el estudio de virus.
- Nematología: el estudio de los nematodos.
- Citología microbiana: el estudio de detalles microscópicos y submicroscópicos de microorganismos.
- Fisiología microbiana: el estudio de cómo funciona la célula microbiana bioquímicamente. Incluye el estudio del crecimiento microbiano, el metabolismo microbiano y la estructura de las células microbianas.
- Ecología microbiana: la relación entre los microorganismos y su entorno.
- Genética microbiana: el estudio de cómo se organizan y regulan los genes en los microbios en relación con sus funciones celulares. Estrechamente relacionado con el campo de la biología molecular.
- Microbiología celular: una disciplina que une la microbiología y la biología celular.
- Microbiología evolutiva: el estudio de la evolución de los microbios. Este campo se puede subdividir en:
- Taxonomía microbiana: la denominación y clasificación de microorganismos.
- Sistemática microbiana: el estudio de la diversidad y la relación genética de los microorganismos.
- Microbiología de generación: el estudio de aquellos microorganismos que tienen los mismos caracteres que sus padres.
- Microbiología molecular: el estudio de los principios moleculares de los procesos fisiológicos en microorganismos.
- Microbiología médica: el estudio de los microbios patógenos y el papel de los microbios en las enfermedades humanas.
- Microbiología industrial: la explotación de microbios para su uso en procesos industriales.
- Microbiología agrícola: el estudio de microorganismos relevantes para la agricultura.
- Microbiología de los alimentos: el estudio de los microorganismos que causan el deterioro de los alimentos y las enfermedades transmitidas por los alimentos.