Mis 2 centavos,
DMSO puede unirse al objetivo de la droga y, por lo tanto, competir con las moléculas pequeñas. Si estás interesado en andamios nuevos, podrías estar perdiéndote. Se podría argumentar que si la molécula es tan débil como un aglutinante no vale la pena buscarla, pero algunos andamios solo necesitan algunos ajustes químicos y la constante de unión puede caer a una escala de uM o nM. He visto algo de proteína en la que el DMSO era un aglutinante apretado, ya que casi no había una molécula pequeña que se uniera al objetivo durante el cribado. Intentamos disolver los compuestos en varios disolventes, como agua / tampón, etanol, metanol y otros. Esto ayudó a aumentar la detección y el descubrimiento de nuevos andamios.
DMSO hace que la membrana celular sea más permeable por lo que ayuda a las moléculas más cargadas a entrar en las células. Esto podría ser algo bueno o malo depende de lo que estés buscando.
Dependiendo del ensayo, DMSO puede interferir con la señal. SPR es un ejemplo, ahora esta desventaja en SPR se supera en gran medida, pero debes ser consciente de esto.
Algunos droguerías comenzarán a desarrollarse con DMSO al 0.5%, lo que significa que el DMSO puede hacer que el fármaco objetivo (proteína) se vuelva inestable y produzca más agregados o una unión súper estequiométrica.
La recomendación sería, si es posible, realizar primero una RMN 1D con diversas concentraciones de DMSO para determinar si la proteína puede desplegarse.
Alternativamente, puede realizar un ensayo de cambio térmico o espectroscopia de CD para determinar el efecto del DMSO en su proteína.
Espero que esto ayude.
