No me queda claro si te refieres a 1) ¿El ser humano tiene eventos de HGT? o 2) si usted, como individuo, se ha sometido a un evento de HGT muy reciente (específico del tejido, no en los gametos)
Me imagino que estás más interesado en el segundo. Para poder saber si ha ocurrido un evento de HGT, necesitas una secuencia de referencia para comparar. Una vez que tenga la línea base, entonces comparará la muestra que sospecha con la línea base.
Si tiene una idea de qué secuencias se pueden haber transferido, solo necesita realizar una PCR para identificar que la secuencia existe en ambas muestras. El tejido sospechoso de HGT y la fuente, mientras que la línea de base se utiliza para mostrar que no está allí para empezar. Esto demuestra que existe en el tejido de muestra si detecta la secuencia. necesitaría expandir la región de interés donde se integró el evento HGT, y luego podría publicar sus hallazgos.
Si no tienes idea de qué se podría transferir o incluso dónde, tienes que hacer una secuenciación del genoma completo y compararla con la línea base. Esto se convierte en un proceso difícil de realizar porque normalmente alineas las lecturas con un andamio conocido. Para garantizar la cobertura en el sitio de integración de HGT, necesitará una gran cantidad de muestras de tejido para obtener lecturas suficientes para realizar una secuencia de novo en todo el sitio de integración.
Para asegurarse de tener suficiente poder para las estadísticas, es mejor que lo haga varias veces o que nadie crea sus resultados, o al menos que sea muy sospechoso.
