Soy un estudiante de medicina con suerte de obtener la universidad este año. ¿Puede haber un problema en el apellido de mi padre en sus identificaciones y mis hojas de calificaciones CBSE?

No. Si su apellido en todos sus documentos es el mismo, no importará. No se le preguntará su identidad.

No.

Esto se puede sumar a través de una declaración jurada si ese requisito se produce

La diferencia de nombres en su ID no causará ningún problema. Básicamente, ven tus marcas y no su identificación